Hay dos páginas principales para conectar con Office 365 usando PowerShell para poder administrar Exchange OnLine.
Instalación y configuración de Windows PowerShell
Y para conectar una vez tengamos instalado el PowerShell
Conexión de Windows PowerShell al servicio
También podemos generar un script llamado por ejemplo LogIn.ps1
$LiveCred = Get-Credential $Session = New-PSSession -ConfigurationName Microsoft.Exchange -ConnectionUri https://ps.outlook.com/powershell/ -Credential $LiveCred -Authentication Basic -AllowRedirection Import-PSSession $Session
Y otro LogOut.ps1
Remove-PSSession $Session
Así podremos conectar y desconectar más fácilmente.
Aqui tienes tambien una página con los cmdlets disponibles en el PowerShell
Referencia a los cmdlets disponibles de PowerShell en Exchange Online